Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Cdc27A2A6Q5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms