Protein–RNA interactions for Protein: A2A5Z6

Smurf2, E3 ubiquitin-protein ligase SMURF2, mousemouse

Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smurf2A2A5Z6 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smurf2A2A5Z6 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms