Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Pkd2l1A2A259 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms