Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms