Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YUW3

Gm5141, Predicted gene 5141, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5141A0A0J9YUW3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm5141A0A0J9YUW3 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms