Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.22□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.21□□□□□ -0.45
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.21□□□□□ -0.45
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