Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Trbv19A0A0B4J1H4 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Trbv19A0A0B4J1H4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv19A0A0B4J1H4 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv19A0A0B4J1H4 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
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Trbv19A0A0B4J1H4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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