Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE3

Trbv15, T cell receptor beta, variable 15 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv15A0A0A6YYE3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv15A0A0A6YYE3 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv15A0A0A6YYE3 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Trbv15A0A0A6YYE3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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