Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC093012.1-203ENST00000548437 450 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP002906.1-201ENST00000603405 233 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-932P-201ENST00000391108 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC107909.2-201ENST00000520844 493 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC022861.1-201ENST00000522981 663 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 PPFIA2-AS1-205ENST00000550938 790 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL136298.1-201ENST00000557371 566 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC023813.2-201ENST00000564321 469 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RN7SL622P-201ENST00000585292 275 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC100781.1-201ENST00000597142 383 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL357054.2-201ENST00000607644 423 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC010133.1-201ENST00000615809 842 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC073052.2-202ENST00000622296 775 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTCYBP32-201ENST00000427945 1084 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AF212831.1-201ENST00000430064 377 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZNF736P11Y-201ENST00000442535 1213 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 TPT1P8-201ENST00000510120 555 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC016925.2-201ENST00000605108 242 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AL450270.1-201ENST00000606160 391 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.35□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 CR848007.2-201ENST00000424918 787 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC006333.1-202ENST00000440504 555 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 TMEM247-203ENST00000449601 741 ntTSL 1 (best) BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 BX322784.1-201ENST00000455793 1077 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
TAF1AQ15573 AC087311.2-201ENST00000549660 320 ntTSL 4 BASIC1.34□□□□□ -2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.1 ms