Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC005162.2-201ENST00000411479 578 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 DLGAP5P1-201ENST00000430307 464 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MRPS17P3-201ENST00000465453 385 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AP000852.1-201ENST00000472460 573 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC114786.4-201ENST00000508771 728 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AF117829.1-204ENST00000519854 284 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AP003122.3-201ENST00000526316 255 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 C14orf105-204ENST00000526336 598 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC012229.1-201ENST00000558699 499 ntTSL 4 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC009145.1-201ENST00000563230 433 ntTSL 3 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC007179.3-201ENST00000604976 235 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC104237.2-201ENST00000612456 443 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AL589740.1-207ENST00000607823 1962 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 PIK3C2G-206ENST00000538779 4963 ntTSL 5 BASIC2.81□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 TEX9-207ENST00000560582 2005 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ZNF85-203ENST00000345030 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ZBTB8OSP1-201ENST00000342688 498 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SNORA62.1-201ENST00000364287 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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CUL3Q13618 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CUL3Q13618 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CUL3Q13618 AC096666.1-201ENST00000454965 348 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Z84488.1-201ENST00000476099 530 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RPS15AP34-201ENST00000487776 387 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC023194.1-201ENST00000493084 308 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RPS27AP10-201ENST00000496103 208 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNU6-1315P-201ENST00000517187 99 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 OR5AL2P-201ENST00000532185 920 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 CLEC2D-214ENST00000543300 399 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 CLEC2D-216ENST00000545918 288 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR4458HG-202ENST00000605918 1057 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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CUL3Q13618 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 AC103710.2-202ENST00000641454 2853 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 MIR767-201ENST00000390228 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
CUL3Q13618 CISD1P1-201ENST00000393907 327 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
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