Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 AL360157.1-201ENST00000565962 87 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC138761.3-201ENST00000579993 334 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AP001972.3-202ENST00000603012 375 ntTSL 3 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC012119.1-201ENST00000603184 222 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 TEX41-265ENST00000627785 704 ntTSL 5 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MYSM1-203ENST00000472487 7785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.02□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SNORA4.3-201ENST00000365564 137 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 NDUFB4P7-201ENST00000423198 363 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC084198.1-201ENST00000477747 402 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SUMO2P6-201ENST00000505273 288 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNA5SP471-201ENST00000516971 106 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC104002.1-201ENST00000557025 380 ntTSL 3 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC090971.5-201ENST00000621102 293 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 DGKH-201ENST00000261491 17261 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 C1orf141-203ENST00000371007 2153 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 CNOT6L-201ENST00000504123 8843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 CDK1-201ENST00000316629 1733 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 OR6A2-202ENST00000641196 4295 ntAPPRIS P1 BASIC4.01□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 ZNF92-204ENST00000450302 2957 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MTCYBP4-201ENST00000401524 249 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 Z85995.1-201ENST00000415547 335 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 ATG3P1-201ENST00000419507 911 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPL31P60-201ENST00000478450 367 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC096576.1-201ENST00000489014 359 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 FTH1P9-201ENST00000513251 355 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 PART1_1.1-201ENST00000611761 217 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC103993.1-201ENST00000521500 1584 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL365361.1-201ENST00000566942 3481 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 SYF2P2-201ENST00000417620 583 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
USP18Q9UMW8 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.2 ms