Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC016866.2-201ENST00000585251 502 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC008521.1-201ENST00000587471 187 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL355877.2-201ENST00000603670 358 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 OR51L1-203ENST00000641819 7300 ntAPPRIS P1 BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 TRDN-201ENST00000334268 4770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC073626.1-201ENST00000415146 582 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 HMGB1P9-201ENST00000429856 646 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPS15AP9-201ENST00000439856 381 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 DPPA3P1-201ENST00000448050 469 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC106038.1-203ENST00000522132 362 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC008114.1-201ENST00000544122 427 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL157871.3-201ENST00000557231 293 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 TANK-204ENST00000403609 555 ntTSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL353678.1-201ENST00000422735 741 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL451074.3-201ENST00000437709 472 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 WASF1P1-201ENST00000447560 1131 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 HTR2A-AS1-202ENST00000452352 384 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC006512.1-201ENST00000468816 291 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC128713.1-201ENST00000471495 306 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC104806.1-201ENST00000508720 308 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR1273C-201ENST00000578669 77 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 CDC27-207ENST00000531206 3177 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL592466.1-201ENST00000428346 307 ntTSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RPS29P15-201ENST00000458329 171 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
HDAC1Q13547 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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