Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL138713.1-201ENST00000624026 2130 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC020571.1-201ENST00000430904 768 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 PTGES3P1-201ENST00000439531 483 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC097478.1-204ENST00000509723 547 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC068880.3-201ENST00000519185 179 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MRPL42-202ENST00000393128 1983 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL365184.1-201ENST00000413801 572 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 NANOGP2-201ENST00000435391 727 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 MTCYBP22-201ENST00000603788 447 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC009974.1-201ENST00000608881 455 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AL512598.1-201ENST00000610158 273 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 AC011939.3-201ENST00000613686 466 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
ITGB3BPQ13352 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
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ITGB3BPQ13352 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 RSU1P2-202ENST00000437884 485 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 AC107882.1-201ENST00000530837 477 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL355598.1-201ENST00000604169 202 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 ELOCP14-201ENST00000428070 331 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC079416.3-201ENST00000624479 549 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 SKIL-202ENST00000413427 2702 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 BTF3P8-201ENST00000414577 526 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
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ITGB3BPQ13352 CLYBL-AS1-201ENST00000416009 621 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 MTCO1P53-201ENST00000441633 699 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL662889.1-201ENST00000453572 389 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
ITGB3BPQ13352 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
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