Protein–RNA interactions for Protein: Q13435

SF3B2, Splicing factor 3B subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B2Q13435 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL137843.1-201ENST00000605078 385 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL158196.1-201ENST00000616786 434 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TEX41-280ENST00000629185 591 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 GABRG2-214ENST00000639111 11735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.3□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 U2SURP-208ENST00000473835 7276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ZRANB3-201ENST00000264159 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MYCBP2-AS1-201ENST00000422231 519 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 EIF4EP1-201ENST00000422311 642 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL445524.1-202ENST00000440665 416 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 LINC01150-201ENST00000455671 315 ntTSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC022493.2-201ENST00000506122 481 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-764P-201ENST00000516396 105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 IGKV2D-23-201ENST00000518179 286 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC008269.2-201ENST00000561915 1105 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC022968.1-201ENST00000567372 442 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC104534.1-201ENST00000594558 566 ntTSL 4 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ESRRAP2-204ENST00000606337 280 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC004925.1-201ENST00000624256 2706 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 GLIPR1-201ENST00000266659 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.29□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNF128-202ENST00000324342 2654 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-512P-201ENST00000364438 103 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNY1P14-201ENST00000384426 108 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 CREM-226ENST00000469949 721 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC092994.1-201ENST00000498604 279 ntTSL 3 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 HTN3-202ENST00000526767 578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC015912.2-201ENST00000571053 181 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AC087588.2-201ENST00000617667 426 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC5.28□□□□□ -1.56
SF3B2Q13435 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 Y_RNA.428-201ENST00000384078 102 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SNRPEP4-201ENST00000435815 279 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 SDAD1P2-201ENST00000441308 2028 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC004692.2-202ENST00000458680 478 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 TRAPPC2P2-201ENST00000517589 409 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC027801.4-201ENST00000518420 395 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.27□□□□□ -1.57
SF3B2Q13435 AC006064.5-201ENST00000541782 248 ntBASIC5.27□□□□□ -1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.1 ms