Protein–RNA interactions for Protein: Q13309

SKP2, S-phase kinase-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKP2Q13309 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 TMBIM4-213ENST00000613669 851 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 OR13C4-201ENST00000277216 957 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 RNU6-1316P-201ENST00000384242 108 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 CoTC_ribozyme.1-201ENST00000408104 192 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 USP9YP26-201ENST00000421008 661 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC01626-201ENST00000431997 452 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 AC009299.3-202ENST00000445372 538 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC010974.1-201ENST00000450509 374 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 MAST4-AS1-201ENST00000451496 777 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC068587.2-201ENST00000478386 781 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
SKP2Q13309 AC009158.1-207ENST00000432973 394 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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SKP2Q13309 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AP003168.1-201ENST00000530091 307 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 MRPS36P5-201ENST00000551909 298 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC009101.2-201ENST00000564293 456 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 LINC02210-208ENST00000585118 546 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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SKP2Q13309 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC024060.1-201ENST00000607052 494 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC093673.2-201ENST00000609674 331 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
SKP2Q13309 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
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