Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS15

LTBP3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,303 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP3Q9NS15 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 ZNF616-204ENST00000600228 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.28-201ENST00000362554 111 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RNU6-1181P-201ENST00000384191 106 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 CCDC126-203ENST00000410069 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC021713.1-201ENST00000526554 510 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC104237.1-201ENST00000527443 539 ntTSL 4 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 LINC02350-201ENST00000544419 480 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL669831.3-213ENST00000636676 183 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 PIKFYVE-201ENST00000264380 9901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RNU6-629P-201ENST00000384061 103 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 LAP3P1-201ENST00000403648 294 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RPL31P12-201ENST00000422587 358 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AF274573.2-201ENST00000437772 520 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 LINC02103-201ENST00000512849 523 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RN7SKP289-201ENST00000517244 295 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 SNRPGP16-201ENST00000533275 226 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC002545.1-201ENST00000592511 181 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 SNRPGP15-201ENST00000600149 222 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 AL360181.4-201ENST00000621752 134 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 NUTM2B-AS1-213ENST00000619625 7611 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 UNC13C-201ENST00000260323 12946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 KPNA2P1-201ENST00000458289 1591 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
LTBP3Q9NS15 ZNF33A-201ENST00000307441 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ELAVL4-203ENST00000371821 3349 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 FKBP7-204ENST00000424785 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 U3.15-201ENST00000365398 212 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC003092.1-201ENST00000415536 639 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AC011933.3-201ENST00000578226 372 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 CDK15-204ENST00000450471 3659 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RASSF6-204ENST00000395777 2735 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 RAP1B-201ENST00000250559 13438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 POSTN-201ENST00000379742 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
LTBP3Q9NS15 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
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