Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 LINC01897-203ENST00000591503 369 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 PISRT1-201ENST00000626175 531 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 NACAP2-201ENST00000318548 624 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 KIF27-203ENST00000376347 1030 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL355497.1-201ENST00000406262 551 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL158840.1-201ENST00000414132 523 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC00368-201ENST00000422994 650 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL117336.1-201ENST00000439198 380 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC018693.1-201ENST00000442829 550 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 FAM103A2P-201ENST00000444122 354 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AHI1-208ENST00000488690 712 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR4293-201ENST00000584305 78 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC011477.3-201ENST00000585571 403 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC012593.1-213ENST00000587255 510 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 BNIP3P27-201ENST00000599991 412 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 THRA1/BTR-203ENST00000604191 571 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC244517.5-202ENST00000623741 500 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC004808.1-201ENST00000627671 721 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 UBE2L2-201ENST00000254302 429 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 KLRC2-202ENST00000381902 1221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 PCYT1B-AS1-201ENST00000432626 275 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL138830.1-201ENST00000435802 402 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC106872.3-201ENST00000495104 446 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AF213884.2-201ENST00000510417 903 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC068587.4-201ENST00000533893 186 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RPS3AP4-201ENST00000555161 764 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AL592221.1-201ENST00000605266 382 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 ZBTB6-201ENST00000373659 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 GPR22-201ENST00000304402 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 AC104454.1-201ENST00000421341 1401 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 SNORD116.1-201ENST00000365628 92 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 MTND1P23-201ENST00000416931 372 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
GABRA6Q16445 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 82.2 ms