Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RPL7P27-201ENST00000403775 720 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL445183.3-201ENST00000414168 502 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL590233.1-201ENST00000430017 456 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL512661.1-201ENST00000434586 1253 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AF127577.1-201ENST00000446301 562 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC093752.1-206ENST00000511823 336 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 NRON-201ENST00000517270 370 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC008632.1-202ENST00000518605 452 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC084706.1-201ENST00000521879 558 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTCYBP23-201ENST00000558717 1102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 GPR171-203ENST00000617554 960 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC104820.1-201ENST00000624183 307 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.52□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTCO1P9-201ENST00000505577 1534 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-657P-201ENST00000383904 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SNORD65C-201ENST00000390962 71 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 UBE2V2P3-201ENST00000433562 437 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 VN1R10P-201ENST00000447106 875 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 TPTE2P6-203ENST00000450973 649 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC090771.2-201ENST00000588794 571 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC091946.2-201ENST00000606105 291 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MINPP1-204ENST00000536010 2215 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 GTF2IP12-201ENST00000456547 356 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC005410.1-202ENST00000460347 485 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-528P-201ENST00000516926 100 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 BIRC6-AS2-201ENST00000623382 589 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 U8.3-201ENST00000363321 132 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU5E-8P-201ENST00000363502 116 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 CD80-202ENST00000383669 771 ntTSL 1 (best) BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RNU6-516P-201ENST00000411381 104 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MTCO3P1-205ENST00000422088 832 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC092393.1-201ENST00000439625 742 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC095056.1-201ENST00000503918 425 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 LINC02379-201ENST00000505741 300 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 Y_RNA.675-201ENST00000516389 149 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
TAF1AQ15573 BNIP3P25-201ENST00000596023 559 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms