Protein–RNA interactions for Protein: Q13115

DUSP4, Dual specificity protein phosphatase 4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP4Q13115 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL23AP65-201ENST00000475608 468 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC02326-201ENST00000552028 540 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL23AP87-202ENST00000573039 466 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC174048.1-201ENST00000603389 144 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC008035.1-201ENST00000607353 448 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SNORD91B-202ENST00000608459 222 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC006065.5-201ENST00000623427 349 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 STON1-GTF2A1L-201ENST00000394751 3534 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AP5M1-201ENST00000261558 11737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IMPG2-201ENST00000193391 8337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RLIMP1-201ENST00000339626 1680 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 GPAM-201ENST00000348367 6371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PTGFR-203ENST00000370758 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SPAM1-202ENST00000340011 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNA5SP502-201ENST00000362694 119 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC009237.10-201ENST00000414112 510 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC090774.1-201ENST00000435925 246 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC104164.2-201ENST00000496953 495 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC093297.2-204ENST00000508945 295 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC090151.1-201ENST00000520784 730 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC022081.1-201ENST00000537327 433 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL049775.2-201ENST00000557547 558 ntTSL 4 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC020661.3-201ENST00000558101 414 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 IQGAP2-204ENST00000502745 3404 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 HIPK3-204ENST00000525975 3668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 STK31-205ENST00000433467 3085 ntTSL 2 BASIC4.44□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PJA2-202ENST00000361557 4645 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC008669.1-201ENST00000565823 2178 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU6-1155P-201ENST00000363554 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 HSPE1P8-201ENST00000406997 288 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RNU2-64P-201ENST00000411315 191 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 BX842559.1-201ENST00000419615 532 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC138024.1-201ENST00000420867 699 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC004875.1-201ENST00000432702 378 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC073063.1-201ENST00000434352 607 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC034195.1-202ENST00000451031 610 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 FAM107B-218ENST00000479731 570 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 OR4H12P-201ENST00000556269 907 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 AC103858.2-201ENST00000621471 543 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
DUSP4Q13115 ZNF678-202ENST00000397097 8212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
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