Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356585.4-201ENST00000623078 1229 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HPGDS-201ENST00000295256 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL354733.1-204ENST00000412069 424 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005104.1-201ENST00000414896 442 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096649.2-201ENST00000416186 393 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ERMN-209ENST00000420719 1246 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NAALADL2-AS2-201ENST00000424690 1038 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGB3P12-201ENST00000438745 556 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU5A-7P-201ENST00000515979 116 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CA1-215ENST00000522389 551 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC136932.1-201ENST00000574771 208 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116312.1-201ENST00000606841 314 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080013.4-201ENST00000607624 649 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPINK9-201ENST00000377906 453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-233P-201ENST00000410845 141 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL449283.1-202ENST00000418249 604 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC087439.2-201ENST00000519498 552 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090971.2-201ENST00000558142 510 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC120349.1-201ENST00000599498 282 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391813.1-201ENST00000603098 260 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL109659.3-201ENST00000624985 950 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DEFB135-201ENST00000382208 234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FABP5P14-201ENST00000437273 393 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DNAJC19P8-201ENST00000452887 259 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003122.4-201ENST00000530980 758 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138473.1-201ENST00000605717 526 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC117490.2-201ENST00000610042 594 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2Q2P6-201ENST00000612666 153 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC007490.1-201ENST00000624321 703 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.53□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-921P-201ENST00000384361 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR135A2-201ENST00000384854 100 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
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