Protein–RNA interactions for Protein: Q15818

NPTX1, Neuronal pentraxin-1, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPTX1Q15818 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL359706.1-201ENST00000437748 315 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FABP5P13-201ENST00000452144 328 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC105252.1-201ENST00000503089 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC117522.1-201ENST00000509821 380 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC087362.1-201ENST00000527912 434 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC126407.1-201ENST00000563044 566 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC005332.10-201ENST00000612725 619 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL161629.2-201ENST00000615347 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SEPT14P19-202ENST00000632397 370 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCO1P12-201ENST00000414273 1543 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FNBP1L-203ENST00000370253 3889 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PIGFP2-201ENST00000421400 651 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC093579.1-201ENST00000439455 352 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LINC01038-201ENST00000457858 428 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC108751.4-201ENST00000462931 1001 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LINC02198-202ENST00000505371 526 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC008948.1-201ENST00000506058 325 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC090531.1-202ENST00000548450 499 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC009145.3-201ENST00000567386 476 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL391840.1-201ENST00000571144 367 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC010928.1-202ENST00000589354 473 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC130324.3-201ENST00000614165 542 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MAPK10-322ENST00000641485 4530 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ATF2-204ENST00000409437 3697 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 TXNDC8-203ENST00000374511 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SNORD15B-201ENST00000384714 146 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 ISCA1P1-201ENST00000426679 387 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL033504.1-204ENST00000434985 413 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 RPL36AP6-201ENST00000435770 321 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 AC079781.2-201ENST00000446424 169 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
NPTX1Q15818 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.1 ms