Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 CCNYL2-203ENST00000638057 730 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01094-203ENST00000504675 1985 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNFT1-201ENST00000305783 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 DEFB107A-201ENST00000335021 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 DEFB107B-201ENST00000355602 389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.245-201ENST00000364493 95 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL590704.1-201ENST00000402856 794 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL591419.1-201ENST00000427423 339 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 FABP5P15-201ENST00000453566 214 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPL23AP11-201ENST00000475260 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC103796.1-201ENST00000530663 358 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC011092.2-201ENST00000533659 586 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ZNF562-205ENST00000587392 583 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC107294.1-201ENST00000609524 467 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC009570.1-201ENST00000609599 745 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CADM2-AS1-201ENST00000476021 2656 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 OR5AK2-201ENST00000326855 996 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA75B-201ENST00000384053 137 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01204-201ENST00000422047 639 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC098614.3-201ENST00000438957 440 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 CLEC4E-202ENST00000446457 701 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC110767.1-201ENST00000508374 239 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC114316.1-201ENST00000511323 278 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC010486.1-201ENST00000511793 424 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RAD17-202ENST00000305138 3164 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 TBC1D15-210ENST00000485960 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA57.1-201ENST00000391227 145 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RPS4XP7-201ENST00000406274 780 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNORA57.3-201ENST00000411095 141 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 LINC01737-201ENST00000412647 403 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL512844.2-201ENST00000433990 593 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL137789.1-201ENST00000439443 682 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 PRPS1P1-201ENST00000445305 876 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBFBQ13951 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.7 ms