Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,018 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AC090617.7-201ENST00000623952 126 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
CNTN1Q12860 AL109837.2-201ENST00000632608 295 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
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CNTN1Q12860 APOH-201ENST00000205948 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
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CNTN1Q12860 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 TRAJ59-201ENST00000390480 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RPS4XP8-201ENST00000402039 771 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CNTN1Q12860 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
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