Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC105271.1-202ENST00000411417 445 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC127391.1-201ENST00000411737 98 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC114808.2-201ENST00000428335 536 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC095032.1-201ENST00000444810 527 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL133351.1-201ENST00000456189 417 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC013267.1-201ENST00000458227 267 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HMGB1P14-201ENST00000557424 591 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC233702.6-201ENST00000584594 396 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP002360.4-201ENST00000606980 481 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AP003399.1-201ENST00000637534 361 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HSPE1P11-201ENST00000339579 310 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-960P-201ENST00000364056 120 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNU6-1035P-201ENST00000384477 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC01797-202ENST00000433432 765 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 LINC01510-201ENST00000441991 468 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RPS24P13-201ENST00000442520 397 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC004924.1-201ENST00000480160 781 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL160314.1-201ENST00000490836 438 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC009901.1-201ENST00000506703 541 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 HMGB1P6-201ENST00000569046 646 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 GLUD1P4-201ENST00000590914 418 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.11-201ENST00000604059 253 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.12-201ENST00000605291 253 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL670379.7-201ENST00000605823 252 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AL162274.2-201ENST00000614406 332 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
RBBP4Q09028 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 177.3 ms