Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU6-952P-201ENST00000391164 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LURAP1L-AS1-201ENST00000417638 799 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC00353-201ENST00000435401 685 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MAL2-203ENST00000534619 578 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MRPL42-208ENST00000552217 920 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC012435.2-201ENST00000562869 361 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC105137.2-201ENST00000569073 466 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC044840.1-201ENST00000577641 472 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC022662.1-201ENST00000580252 331 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 HSFY2-201ENST00000304790 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 HSFY1-201ENST00000307393 1444 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MDM2-207ENST00000360430 891 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 RNU1-39P-201ENST00000383897 165 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 Y_RNA.578-201ENST00000390903 88 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 GTF2IP3-201ENST00000433887 494 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC020550.1-201ENST00000447385 163 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC017099.1-201ENST00000448261 1028 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC114912.1-201ENST00000503394 546 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC078778.1-201ENST00000547177 735 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR5739-201ENST00000619803 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
FAM43BQ6ZT52 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL161449.1-201ENST00000414531 1199 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC009963.1-201ENST00000417265 157 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL136146.2-201ENST00000534594 494 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL133370.1-201ENST00000554679 537 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 DUXAP1-201ENST00000556632 463 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL157938.2-201ENST00000587264 894 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL121652.1-201ENST00000608851 448 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL512506.1-201ENST00000613918 449 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 GYPB-216ENST00000638448 363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 SKA2P1-201ENST00000425592 390 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 SFTA1P-203ENST00000446372 693 ntTSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC110751.1-201ENST00000511916 462 ntTSL 3 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC113145.1-201ENST00000522408 412 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 LRRC6P1-201ENST00000532188 885 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC005774.1-201ENST00000565247 567 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 LINC02109-204ENST00000602801 563 ntTSL 4 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
FAM43BQ6ZT52 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90 ms