Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MAPK8-202ENST00000374174 739 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LINC00844-201ENST00000432535 477 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL078587.1-201ENST00000448580 542 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL133481.3-201ENST00000456546 333 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL138787.2-202ENST00000479395 385 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU1-61P-201ENST00000516107 151 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC004024.1-201ENST00000549244 247 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC012313.1-202ENST00000597309 423 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC090132.2-201ENST00000615881 347 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MTND5P42-201ENST00000637720 498 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 CKAP2P1-201ENST00000555477 2049 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MME-211ENST00000492661 2854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-288P-201ENST00000363690 104 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU1-33P-201ENST00000364249 162 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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RPE65Q16518 MIR34B-201ENST00000385076 84 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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RPE65Q16518 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC008155.2-201ENST00000464337 397 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
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RPE65Q16518 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC034102.8-201ENST00000615146 484 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 hsa-mir-4776-1.1-201ENST00000636364 80 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 ERBIN-212ENST00000508515 4374 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC090740.1-201ENST00000623193 2262 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC006020.1-201ENST00000420179 1854 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 GALNT1-201ENST00000269195 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AKR1C1-201ENST00000380859 858 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6-1197P-201ENST00000391183 107 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.34□□□□□ -1.87
RPE65Q16518 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.34□□□□□ -1.87
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