Protein–RNA interactions for Protein: P21675

TAF1, Transcription initiation factor TFIID subunit 1, human

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene	UniProt Accession	Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TAF1	P21675	DUXAP4-201	ENST00000603046	613 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	BCRP9-201	ENST00000605312	388 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	uc_338.11-201	ENST00000619132	160 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	GPR34-201	ENST00000378138	1815 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC092593.1-201	ENST00000515413	1815 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP006437.1-201	ENST00000641440	3685 nt	BASIC	3.38	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LINC01416-201	ENST00000563553	2310 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SAGE1-201	ENST00000324447	2952 nt	APPRIS P2 TSL 5 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	OR56A5-201	ENST00000340110	738 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-533P-201	ENST00000384144	107 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6ATAC25P-201	ENST00000408798	117 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	YPEL5P1-201	ENST00000419731	367 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTND1P2-201	ENST00000430604	821 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL354977.1-201	ENST00000438147	679 nt	TSL 5 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MACC1-AS1-201	ENST00000439285	639 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC018359.1-201	ENST00000442567	574 nt	TSL 4 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC010095.1-201	ENST00000443543	144 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC021382.1-201	ENST00000483523	359 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MLLT10P2-201	ENST00000506434	249 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC108517.1-201	ENST00000512546	327 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC010493.1-201	ENST00000513479	292 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC017037.2-201	ENST00000513850	890 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC105417.1-201	ENST00000514691	285 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HDAC2-AS2-206	ENST00000517965	850 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL358937.1-201	ENST00000524512	336 nt	TSL 2 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP001893.2-201	ENST00000526949	202 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC243972.3-201	ENST00000539655	198 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	DIAPH2-AS1-203	ENST00000542084	450 nt	TSL 5 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC113137.1-201	ENST00000591869	558 nt	TSL 4 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC099566.1-211	ENST00000595188	737 nt	TSL 5 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ZNF788-206	ENST00000596883	692 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	XIAPP1-201	ENST00000603162	600 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	BNIP3P10-201	ENST00000605360	577 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	C8orf59-209	ENST00000612977	586 nt	APPRIS P1 TSL 2 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	U6atac.1-201	ENST00000616025	117 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC064859.1-201	ENST00000624741	174 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC005832.2-201	ENST00000538921	1430 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	KIAA0586-215	ENST00000619722	5597 nt	APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	FRG1BP-201	ENST00000278882	761 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU6-989P-201	ENST00000362756	107 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	Y_RNA.481-201	ENST00000384373	102 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	BTF3P7-201	ENST00000407097	488 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNA5SP274-201	ENST00000410484	108 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTCO2P11-201	ENST00000431069	680 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	GPR143P-201	ENST00000434155	205 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	PCCA-AS1-203	ENST00000455958	356 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC005538.1-201	ENST00000455991	594 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	GRM7-AS3-209	ENST00000458713	454 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC108078.1-201	ENST00000508073	725 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TRIQK-207	ENST00000519069	598 nt	TSL 4 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC023200.1-201	ENST00000519660	651 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP003467.2-201	ENST00000520175	319 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HMGN1P28-201	ENST00000521340	364 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	DEFB130C-201	ENST00000528518	237 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC087883.1-201	ENST00000551882	391 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CR383656.11-201	ENST00000552261	498 nt	TSL 3 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC068135.2-201	ENST00000569293	1028 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SNORD84-203	ENST00000584275	78 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP001429.1-201	ENST00000602568	530 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC068790.3-201	ENST00000602988	553 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC006329.2-201	ENST00000611491	394 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CNOT6L-201	ENST00000504123	8843 nt	APPRIS P1 TSL 2 BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP001350.1-201	ENST00000601906	1524 nt	BASIC	3.37	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	NR3C1-202	ENST00000343796	7286 nt	APPRIS P3 TSL 5 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	SLC5A3-201	ENST00000381151	11576 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ATXN3L-201	ENST00000380622	2164 nt	APPRIS P1 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	Y_RNA.1-201	ENST00000352915	104 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU5E-8P-201	ENST00000363502	116 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TSHB-202	ENST00000369517	474 nt	APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TRAV26-1-201	ENST00000390455	537 nt	APPRIS P1 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNU4-78P-201	ENST00000410940	126 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL365277.2-201	ENST00000415255	551 nt	TSL 3 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	LINC01780-201	ENST00000420059	442 nt	TSL 2 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AL353148.1-204	ENST00000426752	477 nt	TSL 5 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC073464.1-201	ENST00000429823	534 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC092802.2-202	ENST00000444665	371 nt	TSL 5 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC093899.1-201	ENST00000457984	376 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	APOA2-205	ENST00000468465	421 nt	TSL 2 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RPS3AP17-201	ENST00000472594	777 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HSPE1P6-201	ENST00000479457	291 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC093278.1-201	ENST00000494700	600 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	ARNTL2-AS1-201	ENST00000500498	804 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC016550.2-202	ENST00000511940	581 nt	TSL 2 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	PCAT4-202	ENST00000514836	373 nt	TSL 3 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNA5SP320-201	ENST00000516263	124 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RNA5SP148-201	ENST00000516527	94 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MTND1P5-201	ENST00000517906	940 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AP000462.3-201	ENST00000545593	330 nt	TSL 5 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC009145.3-201	ENST00000567386	476 nt	TSL 3 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	RPL26-207	ENST00000583011	524 nt	APPRIS P1 TSL 3 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC107304.1-201	ENST00000604229	296 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC108747.1-201	ENST00000609508	535 nt	BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	CERS6-AS1-209	ENST00000609766	642 nt	TSL 5 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC008781.3-201	ENST00000622826	335 nt	TSL 2 BASIC	3.36	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	NR5A2-201	ENST00000236914	3115 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.35	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	OR6C70-201	ENST00000327335	939 nt	APPRIS P1 BASIC	3.35	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	HSPE1P11-201	ENST00000339579	310 nt	BASIC	3.35	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	TANK-204	ENST00000403609	555 nt	TSL 1 (best) BASIC	3.35	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	AC079150.1-201	ENST00000413043	383 nt	TSL 3 BASIC	3.35	□□□□□ -1.87
TAF1	P21675	MRPL50P2-201	ENST00000416821	482 nt	BASIC	3.35	□□□□□ -1.87

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