Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 741 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 DLG1-217ENST00000452595 3053 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC063979.1-201ENST00000415539 377 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC073323.1-201ENST00000419832 451 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ZFY-AS1-202ENST00000431145 419 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL691515.1-201ENST00000432976 733 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL162384.1-201ENST00000437881 499 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL356535.1-201ENST00000440335 398 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PHBP16-201ENST00000446318 950 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HMGN2P21-201ENST00000447764 270 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL109763.1-201ENST00000455391 461 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.639-201ENST00000458981 102 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 CREM-230ENST00000474931 626 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC092666.1-202ENST00000493400 442 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 APOOP4-201ENST00000513530 597 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 IGLVIV-65-201ENST00000517313 360 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TRMT10BP1-201ENST00000519377 943 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SMG1P7-203ENST00000573141 619 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC002044.1-201ENST00000606707 158 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Z99571.1-201ENST00000636677 394 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MACF1-231ENST00000564288 24828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC00283-201ENST00000430111 1947 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 EXOC1-202ENST00000349598 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNA5SP322-201ENST00000363617 119 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.534-201ENST00000384599 112 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL355340.1-201ENST00000433085 344 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 HSPD1P21-201ENST00000436541 245 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 NIPA2P5-201ENST00000452282 464 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC087588.1-201ENST00000462203 316 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL359273.1-203ENST00000506295 602 ntTSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC006270.2-201ENST00000578523 652 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL360085.1-201ENST00000604713 532 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 ATP5A1P2-202ENST00000616464 443 ntBASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL589740.1-204ENST00000634677 630 ntTSL 4 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 PCDH11X-205ENST00000373094 9179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 MFSD8-242ENST00000641690 4199 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RNU6-266P-201ENST00000364225 107 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 IARS-201ENST00000375627 697 ntTSL 3 BASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
NCAPHQ15003 RPL5P18-201ENST00000406671 891 ntBASIC4.54□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.5 ms