Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 PKIA-203ENST00000518467 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 HIGD1AP1-201ENST00000550979 275 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 TTN-AS1-212ENST00000582847 1036 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL590491.2-201ENST00000614608 499 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 PHF6-201ENST00000332070 4759 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNU5E-1-201ENST00000362477 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNU6-1284P-201ENST00000363701 100 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 MIR493-201ENST00000385254 89 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 MRPL42P2-201ENST00000403169 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC073614.1-201ENST00000438690 650 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 ELOCP23-201ENST00000452014 332 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC131571.1-202ENST00000454509 598 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL390961.3-201ENST00000458171 485 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 KLF3P2-201ENST00000465138 268 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 LAMTOR3P2-201ENST00000504479 232 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC104304.1-201ENST00000505797 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC010587.1-201ENST00000505809 469 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 RNU6-64P-201ENST00000517119 105 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC084116.3-201ENST00000519123 429 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC012378.1-201ENST00000561155 364 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC093515.1-201ENST00000567103 445 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 MIR2682-201ENST00000580305 110 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL445584.2-201ENST00000614030 616 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC013476.2-201ENST00000614456 459 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 SMAD5-AS1_2.1-201ENST00000617906 131 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 ADAM5-201ENST00000359790 1663 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 KTN1-206ENST00000413890 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 GTPBP8-205ENST00000473129 1518 ntTSL 2 BASIC3.03□□□□□ -1.92
SQLEQ14534 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 OR1S2-201ENST00000302592 978 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 RNU6-278P-201ENST00000390945 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 HMGN2P30-201ENST00000423237 256 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC005019.1-201ENST00000436455 431 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC013727.2-201ENST00000447761 545 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 LINC01758-201ENST00000448001 458 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AL359385.1-201ENST00000456509 365 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC008481.1-201ENST00000463278 396 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 TNFAIP8-205ENST00000504642 711 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC098799.2-201ENST00000509466 868 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC091133.4-201ENST00000511142 308 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC124854.1-202ENST00000513779 339 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SQLEQ14534 AC120045.1-201ENST00000563502 251 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.9 ms