Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DNAJC19P3-201ENST00000594491 331 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC021171.1-201ENST00000603137 706 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC069294.1-201ENST00000608397 350 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC107075.1-201ENST00000613695 314 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC025048.6-202ENST00000627667 438 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL136310.1-201ENST00000404926 654 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL162726.4-201ENST00000422010 673 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 GPM6BP2-201ENST00000432046 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPS12P2-201ENST00000439728 269 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 GPM6BP1-201ENST00000446387 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DYNLL1P5-201ENST00000467158 270 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 C1orf112-206ENST00000472795 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 PRR16-204ENST00000505123 1298 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC02465-201ENST00000507099 532 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 HMGB1P41-201ENST00000520234 440 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 OR5BN1P-201ENST00000532955 829 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 PCLAF-207ENST00000559519 749 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DPPA3P3-201ENST00000603842 430 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC112204.3-201ENST00000623822 332 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL021407.1-201ENST00000404531 386 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL109913.1-201ENST00000421173 514 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL353729.1-201ENST00000425044 720 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 HMGN2P10-201ENST00000448085 265 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC092620.2-201ENST00000458007 744 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 FSBP-201ENST00000481490 1158 ntTSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPS27P27-201ENST00000498779 255 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC026719.1-201ENST00000506059 456 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC016382.1-201ENST00000583580 387 ntTSL 3 BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPP40P2-201ENST00000603596 712 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC103710.1-201ENST00000610003 901 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR19A-201ENST00000384878 82 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL359704.1-201ENST00000411586 781 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 LINC01799-202ENST00000426260 625 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 FCF1P1-201ENST00000432690 571 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 NAALADL2-AS3-202ENST00000453180 413 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AL359273.1-202ENST00000505585 905 ntTSL 1 (best) BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 RNA5SP148-201ENST00000516527 94 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 UBTFL10-201ENST00000528532 562 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 PLCZ1-203ENST00000534932 525 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 YWHAZP1-201ENST00000556286 722 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC061975.8-201ENST00000587058 721 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 MIR7515HG-243ENST00000591400 1067 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
DDX39BQ13838 AC005261.5-201ENST00000596280 355 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms