Protein–RNA interactions for Protein: Q13485

SMAD4, Mothers against decapentaplegic homolog 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4Q13485 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RASAL2-203ENST00000462775 14453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.37□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC02432-202ENST00000509161 2839 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CMYA5-201ENST00000446378 12847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PEAK1-204ENST00000560626 19217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPS6KA5-207ENST00000614987 26795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC021355.1-202ENST00000519996 1633 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ZFAND6-212ENST00000559775 1602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 POU2F1-212ENST00000541643 13937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TCP11X1-203ENST00000623912 1715 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPLP0P7-201ENST00000416050 667 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPL21P91-201ENST00000429231 479 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL050349.1-201ENST00000441029 401 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC010655.1-201ENST00000449336 292 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 snoU109.4-201ENST00000458953 143 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AP000926.1-201ENST00000479573 241 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RN7SL432P-201ENST00000484057 298 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MDM4-213ENST00000507825 481 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MRPS35P2-201ENST00000508242 191 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RANP3-201ENST00000530970 276 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC079610.3-201ENST00000606960 147 ntTSL 3 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC015914.2-201ENST00000618167 288 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 NRDE2-210ENST00000628832 132 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL732372.2-225ENST00000642124 456 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RBMS3-205ENST00000434693 8540 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CDK14-201ENST00000265741 4953 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GABPAP-201ENST00000419271 1356 ntBASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL049830.3-201ENST00000555108 1991 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 FAP-203ENST00000443424 2598 ntTSL 2 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 OR6P1-202ENST00000641540 3255 ntAPPRIS P1 BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC4.36□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL672167.1-204ENST00000641875 3017 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC126323.6-202ENST00000568092 3511 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RAD17-203ENST00000345306 2789 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU6-637P-201ENST00000384050 107 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RN7SKP177-201ENST00000410567 355 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC010967.2-201ENST00000418451 333 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RPL23AP69-201ENST00000431134 458 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL138916.1-201ENST00000436295 455 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LAMTOR5P1-201ENST00000444290 270 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 LINC01005-202ENST00000451440 531 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC025475.1-201ENST00000512939 487 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 IGHV4OR15-8-201ENST00000557788 353 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC098617.1-215ENST00000594798 1152 ntTSL 5 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 ZNF432-203ENST00000597273 624 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL670379.6-201ENST00000603753 252 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC104695.3-201ENST00000604052 296 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AC008162.1-201ENST00000604718 254 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL670379.1-201ENST00000604752 252 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL670379.5-201ENST00000605253 252 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
SMAD4Q13485 AL670379.8-201ENST00000605353 252 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
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