Protein–RNA interactions for Protein: Q13003

GRIK3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK3Q13003 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GSTA9P-201ENST00000406231 611 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIR1290-201ENST00000408735 78 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL355989.1-202ENST00000419406 408 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL27AP8-201ENST00000424277 446 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 C1DP4-201ENST00000455429 424 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 HMGN1P18-201ENST00000457642 277 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC02315-201ENST00000515218 696 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNA5SP468-201ENST00000516782 93 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC093012.1-202ENST00000549403 582 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 BLOC1S6-206ENST00000564765 706 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AF038458.1-201ENST00000588406 262 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC016229.1-201ENST00000589242 487 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIR98-201ENST00000606724 119 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 HOTAIRM1_2.1-201ENST00000616712 215 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL136313.1-201ENST00000624804 202 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP003481.1-201ENST00000637808 351 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FIGNL1-202ENST00000395556 3485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 DCUN1D1-201ENST00000292782 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CR848007.1-201ENST00000442354 1699 ntBASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC3.46□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 OR6C70-201ENST00000327335 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA7.4-201ENST00000384249 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC132479.1-201ENST00000449160 144 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC108727.1-201ENST00000513802 393 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
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GRIK3Q13003 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AP001172.2-201ENST00000602454 467 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC135507.2-201ENST00000612443 309 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC068880.5-201ENST00000624331 290 ntBASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC3.45□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 AF274854.1-201ENST00000413236 615 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
GRIK3Q13003 RPL7P46-201ENST00000425129 740 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
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