Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 AC090229.1-201ENST00000590983 1609 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SLC25A46-206ENST00000509432 1596 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MSTN-201ENST00000260950 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU6-851P-201ENST00000384565 107 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC023051.1-201ENST00000414098 876 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AL035410.1-201ENST00000427409 427 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AL033539.1-201ENST00000427775 743 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC093019.1-201ENST00000443135 252 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC073342.1-202ENST00000446192 457 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 HMGB3P21-201ENST00000452483 547 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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MEIS3Q99687 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RN7SKP96-201ENST00000516948 297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC025575.1-201ENST00000548497 544 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 CBX3P5-201ENST00000552017 521 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 LINC01539-206ENST00000593282 678 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AL359999.1-201ENST00000604513 294 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC007621.1-201ENST00000604544 437 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 BNIP3P10-201ENST00000605360 577 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC009159.1-201ENST00000618386 642 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 BMS1P21-201ENST00000634565 365 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 FILIP1L-209ENST00000487087 2321 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
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MEIS3Q99687 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AL049780.3-201ENST00000624612 1583 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 LPAR6-209ENST00000620633 2175 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 MIR181B1-201ENST00000385240 110 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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MEIS3Q99687 AL352984.1-201ENST00000556949 276 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 LINC01905-202ENST00000588139 459 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 Z84480.1-201ENST00000605131 311 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC007038.2-201ENST00000608095 740 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 OR10AB1P-201ENST00000609613 938 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 BX664608.1-201ENST00000610519 487 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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MEIS3Q99687 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 RTKN2-202ENST00000373789 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 TRIQK-212ENST00000520686 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
MEIS3Q99687 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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