Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 SCOC-202ENST00000394201 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02331-201ENST00000418927 602 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 ZNF863P-201ENST00000426746 417 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC002542.1-201ENST00000440683 193 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RPL21P134-201ENST00000453468 483 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 ATG12P2-201ENST00000456830 416 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AGBL4-IT1-201ENST00000457061 514 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 YWHAEP4-201ENST00000505390 198 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC034234.1-202ENST00000508696 339 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC109471.1-201ENST00000511631 612 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP000942.2-201ENST00000526310 628 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC008741.1-201ENST00000569456 510 ntTSL 3 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC007349.4-201ENST00000608114 532 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP002791.1-201ENST00000623291 381 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL121759.2-201ENST00000636173 570 ntTSL 4 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 CEP162-201ENST00000257766 5063 ntTSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC1.7□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MTND5P30-201ENST00000452896 1731 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 HMGB1-201ENST00000326004 821 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL138830.2-202ENST00000446358 786 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC005538.1-201ENST00000455991 594 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 snoU109.1-201ENST00000459339 135 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC025181.1-201ENST00000477507 416 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC127894.1-201ENST00000548266 851 ntTSL 3 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC079411.1-201ENST00000565441 795 ntTSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC068631.1-221ENST00000626006 592 ntTSL 5 BASIC1.69□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 DIRC1-201ENST00000308100 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL356131.1-201ENST00000405826 414 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL357078.2-201ENST00000416486 427 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC00692-201ENST00000451284 932 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC113347.4-201ENST00000506032 685 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC048346.1-201ENST00000510247 144 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LINC02382-201ENST00000515840 614 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL139021.2-201ENST00000556390 399 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL358333.2-201ENST00000556834 529 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC093519.1-201ENST00000566109 298 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC023824.3-201ENST00000569003 562 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL158801.5-201ENST00000623123 465 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL512506.2-201ENST00000624472 458 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 OR5T1-202ENST00000641665 1471 ntAPPRIS P1 BASIC1.68□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AKAP14-203ENST00000371425 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 RNU6-1005P-201ENST00000384519 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 SNORD116-23-201ENST00000384645 92 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MCTS2P-201ENST00000394552 546 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
TAF1AQ15573 MTND2P24-201ENST00000453434 806 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
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