Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SNORA31.6-201ENST00000516241 130 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC006199.1-201ENST00000548728 219 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC005476.1-201ENST00000554427 397 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC135628.1-201ENST00000568867 534 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC069114.1-201ENST00000580927 287 ntTSL 2 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC090616.5-201ENST00000581225 299 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC007673.1-201ENST00000590604 1100 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC121334.2-201ENST00000605387 271 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 DLEU2_6.1-201ENST00000610536 112 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC011890.2-201ENST00000613393 294 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MESTIT1_2.1-201ENST00000616328 235 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC128685.1-201ENST00000490357 1834 ntTSL 5 BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.69□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SIRT1-202ENST00000403579 3333 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 SPAG11A-202ENST00000326625 445 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 USP9YP6-201ENST00000413550 854 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 B3GALNT1P1-201ENST00000420569 975 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MTCO3P30-201ENST00000426425 670 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL356859.1-201ENST00000449180 414 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL121769.1-201ENST00000469473 401 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 IGKV3OR22-2-201ENST00000517943 313 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC073657.2-201ENST00000605661 303 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR6810-201ENST00000622701 70 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR7157-201ENST00000635801 60 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CCDC82-202ENST00000423339 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ESCO1-201ENST00000269214 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CDK1-202ENST00000373809 1613 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MTND4P35-201ENST00000604257 1375 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP515-201ENST00000364570 118 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ATP5F1P3-201ENST00000397213 657 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPS12P24-201ENST00000412619 387 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC016710.1-201ENST00000421326 466 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 ATP5JP1-201ENST00000431631 322 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RPL22P17-201ENST00000438729 315 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CBX3Q13185 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNU7-26P-201ENST00000458980 63 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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CBX3Q13185 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 OR5B10P-201ENST00000532869 642 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 MIR3167-201ENST00000579623 85 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AP001981.2-201ENST00000603241 418 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL162713.1-201ENST00000604480 262 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC069200.1-201ENST00000609511 323 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 uc_338.14-201ENST00000613162 166 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AL731566.2-201ENST00000618971 317 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 Z99129.2-201ENST00000619967 314 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CLECL1-204ENST00000621400 611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 LINC02246-205ENST00000627623 417 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC127502.3-201ENST00000636170 1206 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
CBX3Q13185 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
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