Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PPP1R11P2-201ENST00000423543 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL596220.1-202ENST00000429768 314 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MED14P1-201ENST00000430517 648 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC017048.2-201ENST00000431455 822 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RPL26P6-201ENST00000440913 438 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 COX6CP2-201ENST00000444980 225 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MIR217HG-201ENST00000446139 900 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 TPT1P14-201ENST00000448018 505 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 MTND1P9-201ENST00000453775 944 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PCCA-AS1-203ENST00000455958 356 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RNU6-420P-201ENST00000458780 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AP000797.1-201ENST00000478870 387 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL139147.1-201ENST00000502413 1156 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC117522.2-201ENST00000510049 657 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC007513.1-201ENST00000548740 379 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC060771.1-201ENST00000582031 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ABBA01006766.1-201ENST00000584728 294 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AL358072.1-201ENST00000604156 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC004852.3-201ENST00000614131 326 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC008443.7-201ENST00000622195 246 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
LRRTM2O43300 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 APC-201ENST00000257430 10701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 STAU2-201ENST00000355780 4061 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MTND1P28-201ENST00000435623 950 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC097347.1-201ENST00000438499 517 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL390961.1-201ENST00000446557 319 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL359915.2-203ENST00000457043 540 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC010280.1-201ENST00000515199 340 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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LRRTM2O43300 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MEG8-218ENST00000556720 456 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC066612.2-201ENST00000559875 695 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MIR548AB-201ENST00000584917 84 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC083798.2-205ENST00000608015 575 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC093591.3-201ENST00000634516 308 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ZBBX-204ENST00000392767 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 FGF14-201ENST00000376131 12882 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC092125.1-201ENST00000562568 1995 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNY4P24-201ENST00000362735 96 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU1-105P-201ENST00000363470 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RNU6-1078P-201ENST00000364522 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC110754.1-201ENST00000399740 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CCNG1P1-201ENST00000406783 885 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 PPP1R1C-203ENST00000409702 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 BX682237.1-201ENST00000415016 335 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 CCDC58P2-201ENST00000417131 366 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 USP9YP13-201ENST00000417797 480 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 RBM6-203ENST00000421682 684 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL157786.1-206ENST00000424422 551 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
LRRTM2O43300 AC007879.4-201ENST00000440545 361 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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