Protein–RNA interactions for Protein: T1NXB5

Vstm4, V-set and transmembrane domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm4T1NXB5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Vstm4T1NXB5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms