Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Knop1Q9Z2Q2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms