Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2P8

Vamp5, Vesicle-associated membrane protein 5, mousemouse

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Length 102 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp5Q9Z2P8 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Vamp5Q9Z2P8 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ext1-201ENSMUST00000077273 7663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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Vamp5Q9Z2P8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Camkk2-201ENSMUST00000111668 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vamp5Q9Z2P8 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vamp5Q9Z2P8 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Vamp5Q9Z2P8 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
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Vamp5Q9Z2P8 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
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Vamp5Q9Z2P8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Vamp5Q9Z2P8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms