Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2L7

Crlf3, Cytokine receptor-like factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crlf3Q9Z2L7 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Crlf3Q9Z2L7 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Crlf3Q9Z2L7 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 132.8 ms