Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2H7

Gipc2, PDZ domain-containing protein GIPC2, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gipc2Q9Z2H7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gipc2Q9Z2H7 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gipc2Q9Z2H7 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms