Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Mbd3Q9Z2D8 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Mbd3Q9Z2D8 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms