Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2A0

Pdpk1, 3-phosphoinositide-dependent protein kinase 1, mousemouse

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Length 559 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdpk1Q9Z2A0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
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Pdpk1Q9Z2A0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdpk1Q9Z2A0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
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