Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z261

Cldn7, Claudin-7, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn7Q9Z261 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn7Q9Z261 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms