Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Y4

Trip6, Thyroid receptor-interacting protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip6Q9Z1Y4 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Trip6Q9Z1Y4 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Trip6Q9Z1Y4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms