Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T2

Thbs4, Thrombospondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thbs4Q9Z1T2 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Thbs4Q9Z1T2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Thbs4Q9Z1T2 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms