Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
NfkbiaQ9Z1E3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms