Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1D8

Zkscan5, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 5, mousemouse

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zkscan5Q9Z1D8 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Zkscan5Q9Z1D8 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Zkscan5Q9Z1D8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms