Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cpne6Q9Z140 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cpne6Q9Z140 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms