Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
NgfrQ9Z0W1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
NgfrQ9Z0W1 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms